Elk primair lipoproteïne wordt gekenmerkt door de aanwezigheid in de samenstelling van een individueel, alleen inherent eiwit (apolipoproteïne). Apolipoproteïnen worden aangegeven in Latijnse letters, waarvan sommige een familie van eiwitten zijn en ook worden aangegeven met getallen (bijvoorbeeld apo-A1, apo-A2, enz.).