Bij ernstige en aanhoudende manifestaties van deze ziekte worden klinische behandeltrajecten gevolgd. Fysiotherapie voor vegetatieve-vasculaire dystonie omvat in dit stadium elektroslaaptherapie, galvanisatie en elektroforese met geschikte medicijnen in bepaalde zones, darsonvalisatie van lokale pijnlijke plekken op het lichaam van de patiënt, blootstelling aan diadynamische stromen, lasertherapie (magnetische laser), hydrotherapie en balneotherapie volgens algemeen aanvaarde methoden, afhankelijk van de vorm van de ziekte.