In sommige gevallen, vaker voor bij vrouwen, acute pyelonefritis begint met acute cystitis (hartkloppingen en pijn bij het plassen, pijn in de blaas, terminal hematurie). Andere symptomen van acute mielonefrita: algemene zwakte, vermoeidheid, spierpijn, hoofdpijn, gebrek aan eetlust, misselijkheid, braken.