Symptomen van vitamine B12-malabsorptie ontwikkelen zich vanaf de eerste levensmaanden van een kind. Zwakte, bleekheid, vertraagde lichamelijke ontwikkeling en diarree worden opgemerkt. Neurologische aandoeningen worden 6-30 maanden na het begin van de eerste symptomen opgemerkt: mentale retardatie, neuropathie, myelopathie.