Symptomen van malabsorptie van vitamine B12 ontstaan vanaf de eerste maanden van het leven van het kind. Ze noteren zwakte, bleekheid, vertraging in lichamelijke ontwikkeling, diarree. Na 6-30 maanden na het begin van de eerste symptomen, worden neurologische aandoeningen opgemerkt: mentale retardatie, neuropathie, myelopathie.