Alloimmune of iso-immune neutropenie van pasgeborenen treedt op in de foetus vanwege de antigene onverenigbaarheid van de neutrofielen van de foetus en de moeder. De iso-antilichamen van de moeder behoren tot de IgG-klasse, ze dringen de placentabarrière binnen en vernietigen de neutrofielen van het kind. Iso-antilichamen zijn meestal leukoagglutininen, ze reageren met de cellen van de patiënt en zijn vader, reageren niet met de cellen van de moeder.